年终奖并入工资发放还是单独发放，各有其优缺点，哪种方式更合适取决于多种因素，以下是具体分析：
并入工资发放
优点
员工心理感受稳定：对于一些依赖固定收入来规划生活和财务的员工来说，将年终奖并入工资意味着每月的收入更加稳定可预期，这有助于减少因收入波动带来的经济压力和不确定性，让员工在心理上更有安全感。
体现薪酬的公平性：在一些企业中，如果年终奖的发放标准不够明确或存在不公平的情况，将其并入工资可以避免因奖金差异而引起的员工不满和矛盾，通过统一纳入工资体系，按照既定的工资制度进行核算和发放，可以增强员工对薪酬公平性的认同感。
便于税务筹划（特定情况下）：从税收角度来看，在某些地区或特定政策下，将年终奖并入工资可能会使员工适用更低的税率，因为年终奖单独计税时，可能会因金额较大而适用较高的边际税率；而并入工资后，综合所得可能适用较低的平均税率，从而在一定程度上减轻员工的税务负担。
缺点
激励效果可能减弱：年终奖的一个重要作用是对员工一年工作表现的认可和激励，如果将其并入工资，可能会导致这种激励作用被削弱，员工可能会觉得每个月的工资是固定的，缺乏为了获取额外奖励而努力工作的动力。
企业成本控制难度增加：并入工资发放意味着企业在全年都需要承担相对较高的薪酬支出，这可能会对企业的成本控制和现金流管理带来一定压力，特别是对于一些业绩波动较大或资金紧张的企业来说，可能难以在全年维持较高的薪酬水平。
适用场景
企业业绩稳定：企业的业绩相对稳定，没有明显的季节性或周期性波动，且希望为员工提供稳定的收入保障，这种情况下可以考虑将年终奖并入工资。
行业特点决定：某些行业的工作性质决定了员工的工作效率和成果相对稳定，如公务员、事业单位工作人员等，这些单位通常采用较为稳定的薪酬体系，将年终奖并入工资更符合其职业特点和管理需求。
员工需求倾向：当企业通过调研发现大多数员工更倾向于稳定、可预期的收入方式，对短期激励的需求相对较低时，并入工资可能是一个合适的选择。
单独发放
优点
激励作用显著：年终奖作为对员工一年工作的额外奖励，能够激发员工的工作积极性和创造力，促使他们在新的一年里更加努力地工作，与工资分开发放可以突出其奖励性质，让员工更加直观地感受到自己的努力和付出得到了认可和回报。
灵活调整奖励额度：企业可以根据自身的经营业绩、员工个人表现等因素，灵活确定年终奖的发放额度和方式，在业绩好的年份，企业可以发放丰厚的年终奖，以激励员工继续保持优秀的工作表现；而在业绩不佳的年份，适当减少年终奖的发放额度，也可以帮助企业控制成本。
体现绩效差异：单独发放年终奖可以更好地体现员工之间的绩效差异，企业可以根据员工的工作岗位、工作表现、业绩贡献等因素，制定不同的年终奖发放标准，拉开差距，让优秀员工得到更多的奖励，从而鼓励员工积极进取，提高工作绩效。
缺点
员工收入不稳定：单独发放年终奖会使员工的收入在一年中出现较大的波动，对于那些依赖年终奖来偿还债务、支付大额开支或进行储蓄规划的员工来说，可能会造成一定的经济压力和不便。
可能引发内部不公平感：如果年终奖的发放标准不透明或不合理，可能会引发员工之间的比较和不满，一些员工认为自己的努力和贡献没有得到应有的回报，或者与其他同事相比存在不公平待遇，从而影响团队的凝聚力和工作积极性。
适用场景
企业业绩波动大：企业的经营业绩受到市场环境、季节变化等因素的影响较大，具有明显的周期性或波动性，在这种情况下，单独发放年终奖可以根据企业的实际盈利情况进行调整，既能激励员工在业绩好的时期努力工作，又能在业绩不佳时合理控制成本。
激励员工追求卓越：企业希望鼓励员工在工作中不断创新、追求卓越，提高个人绩效和企业整体效益，将年终奖作为一种重要的激励手段单独发放，可以更有效地激发员工的积极性和创造力。
员工绩效差异明显：企业内部员工的工作表现和业绩贡献差异较大，需要通过差异化的奖励机制来体现公平性和激励性，单独发放年终奖可以根据员工的绩效评估结果，给予不同额度的奖励，让优秀员工得到充分的激励和认可。
